Pelajar-pelajar Madrasah Muhammadiah berpeluang melanjutkan pengajian ke:-
Kolej Universiti Islam Antarabangsa Sultan Ismail Petra:
- KIAS: Diploma 3 tahun + 2 tahun Universiti Al-Azhar
- KIAS: 4 tahun Ijazah Sarjana Muda.
Institut Pengajian Tinggi Awam dan Swasta (IPTA/IPTS) di dalam dan luar negara.